1、目标不同：会员制期货交易所通常不以营利为目标，公司制期货交易所通常是以营利为目标，追求交易所利润最大化。

2、规定不同：会员制期货交易所一般适用民法的有关规定，公司制期货交易所首先适用公司法的规定，只有在公司法未作规定的情况下，才适用民法的规定。

3、最高权力机构不同：会员制期货交易所的最高权力机构是会员大会，公司制期货交易所的最高权力机构是股东大会。

4、常设机构不同：会员制期货交易所最高权力机构的常设机构是理事会，公司制期货交易所最高权力机构的常设机构是董事会。

期货交易所管理办法：

1、为了加强对期货交易所的监督管理，明确期货交易所职责，维护期货市场秩序，促进期货市场积极稳妥发展，根据《期货交易管理条例》，制定本办法。

2、本办法适用于在中华人民共和国境内设立的期货交易所。

3本办法所称期货交易所是指依照《期货交易管理条例》和本办法规定设立，不以营利为目的，履行《期货交易管理条例》和本办法规定的职责，按照章程和交易规则实行自律管理的法人。

4、经中国证券监督管理委员会（以下简称中国证监会）批准，期货交易所可以采取会员制或者公司制的组织形式。

5、会员制期货交易所的注册资本划分为均等份额，由会员出资认缴。公司制期货交易所采用股份有限公司的组织形式。